抗がん剤など高活性医薬品の増加で、特に飛散性の高い粉末原料を取り扱う設備では製品品質に加え作業者安全の観点からアイソレータやスプリットバルブを使用したコンテイメント性能が要求されてきています。

製剤工程はコンテナを使用してバッチ単位で取り扱われるので、コンテナ（粉と錠剤用では形状が異なる）とリフターまたは真空搬送装置などと製造装置の取り合いの設計が必要となります。

封じ込めが必要な製剤の場合は、上記にさらにスプリットバルブが加わり各装置の水平、高さの位置の精度が求められ、コンテナの動作とバルブの動作を含めた複雑な設計が必要となります。

装置も粉砕機、造粒機、打錠機、フィルムコート機、カプセル充填機、重量選別機、分包機などそれぞれ封じ込めレベル、能力、サンプリング、集塵、洗浄方法などに特徴を持った国内、海外メーカー製品があり、それぞれ評価選択することになります。また、使用済みコンテナを封じ込めたまま洗浄するコンテナ洗浄機も必要となります。

以上を考慮して、メカニカルフローと呼ばれる図を作成してお客様と確認しながら設計を進めます。

これまでのコンテナを使用たバッチ方式に代わり、工程間で原料、中間製品を自動搬送して連続的に製造する連続装置が開発されています。PAT（Process Analytical Technology)と呼ばれるインライン（In Line）、オンライン（On Line）、アットライン（At Line）で近赤外線センサー（NIR）、ラマン分光装置などで直接製品品質をモニターする技術が使われています。リアルタイムリリーステスティング（RTRT)実現の可能性も有しています。

錠剤の識別のため打錠時に刻印を行いますが、錠剤の識別性向上のため、品名をカタカナなどで直接錠剤にインクジェットやレーザーで印刷する印字検査装置が各社から多数上市されており、必要に応じて選択することができます。

包装では医薬品の取り違えによる医療事故の防止及びトレーサビリティの確保のためバーコード表示が義務化され、包装工程での印字・検査装置が必要となっています。また、海外へ輸出する場合は、シリアライゼーションなどの対象国の規制に沿った表示の対応が必要となります。

単価の高い医薬品で、特に海外へ輸出する製品の表示材料などへの様々な偽薬防止技術があります。

異種品コンタミ防止のため、生産スペースの区画とレイアウト及び生産開始・終了時にラインクリアランスがやり易い設備仕様とします。検査装置が増えることに伴い、系列外排除品が増えることになりますが、不良品の混入のリスクを排除させるためには極力誤検知品を少なくすることと、排除品を処理する十分なスペースを計画することが重要です。また、容器の洗い直しを行う共有の洗い場や、容器を運ぶ製品缶内の残存確認への配慮が必要です。